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1

 

 

Programma () del corso di

Chimica Organica per Biotecnologie

   Programma

In questo corso si vuole fornire agli studenti la conoscenza della chimica organica di base e delle principali reazioni organiche propedeutiche ai successivi corsi  di indirizzo tipici del corso di laurea in Biotecnologie. Si prefigge l’obiettivo di far apprendere elementi di spettroscopia IR, NMR protonica e di carbonio-13 e spettrometria di massa nonché di far acquisire manualità di laboratorio attraverso una serie di esperienze didattiche. 

 

   Contenuti:

1.

Introduzione alla Chimica Organica: origine della vita, la chimica organica nella vita di oggi. Il legame chimico: orbitali atomici e teoria degli orbitali molecolari. Orbitali molecolari di frontiera. La geometria molecolare. Richiamo ai concetti di acido e base e alle reazioni redox.

2.

Il Carbonio: la struttura tetraedrica negli alcani, orbitali ibridizzati sp3 e legami σ. Altri atomi con ibridizzazione sp3. Atomo di carbonio trigonale negli alcheni: orbitali ibridizzati sp2 e legami π, altri atomi con orbitali ibridizzati sp2. Atomo di carbonio negli alchini: orbitali ibridizzati sp. Legami covalenti con carboni sp3, sp2 e sp: lunghezza e forza dei legami. Elettronegatività del carbonio, legami e reattività chimica. Gruppi funzionali al carbonio: alogenuri, alcoli, eteri, composti carbonilici, carbossilici e derivati, ammine, nitrili. Il benzene. Concetti di risonanza e tautomeria cheto-enolica. Struttura, gruppi funzionali e forze intermolecolari: interazioni dipolo-dipolo, legame a idrogeno, legami di Van der Waals.

3.

Introduzione alle reazioni organiche e loro meccanismi: relazioni termodinamiche. Diagrammi di energia: S.T. o complesso attivato. Valori termodinamici relativi allo S.T. Cinetica di una reazione; velocità e ordine di una reazione, rapporto con G di attivazione e passaggio determinante la velocità. Omolisi ed eterolisi di legami covalenti. Carbocationi e carbanioni e stabilità relative. Radicali e criteri di stabilità. Carattere acido o basico dei vari gruppi funzionali. Effetto dei cambiamenti di struttura sull’acidità e la basicità. Effetto induttivo e di risonanza. Definizione di reagenti elettrofili e nucleofili. Concetto di regio e stereoselettività di una reazione organica.

4.

Alcani e Cicloalcani: struttura e nomenclatura IUPAC, radicali alchilici. Isomeri strutturali. Isomeria e proprietà fisiche. Isomeria conformazionale: definizione ed esempi via diagrammi di energia (etano e butano). Origine degli alcani nel petrolio; processi di cracking. Reattività degli alcani verso gli alogeni: alogenazione radicalica.  I cicloalcani: stabilità relativa e tensione d’anello. Ciclopentano e cicloesano. Conformazione del cicloesano e dei cicloesani sostituiti: idrogeni assiali ed equatoriali, la stereoisomeria cis-trans. Analisi conformazionale. Principali metodi di sintesi di alcani e cicloalcani.

5.

Stereochimica: isomeri costituzionali e stereoisomeri. Enantiomeri e diastereoisomeri. Nascita dell’asimmetria. Chiralità. Carbonio chirale e stereocentro. Relazioni tra stereoisomeri configurazionali: enantiomeri e racemi. Luce polarizzata ed attività ottica. Regole di rappresentazione di composti chirali (R,S o D,L). Strutture proiettive di Fisher. Composti con più stereocentri: diastereoisomeri e mesoforme. Stereoisomeria nei composti ciclici: configurazioni e conformazioni. Risoluzione racemica e sintesi asimmetrica. La stereoisomeria dei composti ciclici.

6.

Alcheni e alchini: nomenclatura IUPAC; gruppi allile e vinile. Isomeria geometrica e proprietà chimico-fisiche; stabilità degli alcheni con diversa sostituzione. Reattività: addizioni elettrofile di acidi alogenidrici, acqua, acido solforico, alogeni (Br2). Meccanismo, stereochimica e cinetica delle reazioni, regola di Markovnikov. Formazione di alcoli per idroborazione, ossimercuriazione e demercuriazione. La formazione di aloidrine. Ossidazione di doppi legami: formazione di glicoli con permanganato di potassio e tetrossido di osmio; reazioni con peracidi e formazione di epossidi. Stereoselettività nelle reazioni di ossidazione. Reazione di idrogenazione: catalisi (omogenea ed eterogenea), meccanismo e cinetica; stereo e chemoselettività della reazione di idrogenazione. Alchini: definizioni e nomenclatura; acidità degli alchini, acetiluri metallici. Addizioni elettrofile al triplo legame, meccanismo e regioselettività. Idrogenazione del triplo legame parziale e totale. Addizione di acqua: prodotti di reazione. Principali metodi di sintesi di alcheni ed alchini. 

7.

Reazioni di sostituzione nucleofila ed eliminazione al carbonio saturo: cinetica e meccanismo delle reazioni SN1 e SN2; competizione tra i due meccanismi; stereochimica delle reazioni via SN1 o SN2. Nucleofili e nucleofilicità: confronti tra diversi nucleofili. Effetto sterico, polarizzabilità. Solventi nelle reazioni di sostituzione; classificazione ed effetto. Gruppi uscenti: definizione e confronto; trasformazione di gruppi uscenti. Reazioni di eliminazione: cinetica e meccanismo delle reazioni E1 ed E2; regioselettività e stereochimica nelle reazioni di eliminazione. Competitività tra reazioni di sostituzione ed eliminazione. La chimica degli alogenuri alchilici: preparazione e reattività.

8.

Alcoli, eteri ed epossidi: struttura e nomenclatura; proprietà chimico-fisiche degli alcoli e degli eteri. Preparazione degli alcoli. Le reazioni degli alcoli. Trasformazione di alcoli in alogenuri alchilici. Metodi di protezione della funzione ossidrilica. Trasformazione della funzione alcolica in tosilato e mesilato, buoni gruppi uscenti. Preparazione di eteri (Sintesi di Williamson). Reazione di aloidrine per la preparazione di epossidi (sostituzione nucleofila intramolecolare). Rottura del legame etereo. Apertura di epossidi.

9.

I composti organometallici: preparazione di composti organolitio ed organomagnesio. Reazioni dei composti organometallici con epossidi e con composti carbonilici.

10.

Aldeidi e chetoni: aldeidi e chetoni: il gruppo carbonilico, sua struttura e reattività verso reagenti nucleofili ed elettrofili. Nomenclatura e proprietà fisiche di aldeidi e chetoni. Principali metodi di sintesi di aldidi e chetoni. Reazione di addizione nucleofila: formazione di emiacetale e acefali, formazione di immine e enammine, addizione di ilidi al fosforo. Reazioni con reattivi di Grignard. Composti carbonilici come acidi e basi (enoli ed enolati, tautomeria). Reazioni di condensazione aldolica. Formazione regioselettiva di enolati. Reazioni di addizione a composti carbonilici -insaturi: reazione di addizione di Michael.

11.

I sistemi insaturi coniugati: il catione allilico: forme di risonanza e stabilità. I dieni coniugati e loro stabilità. L’attacco elettrofilo ai dieni coniugati: addizione 1,2 e 1,4.

12.

La chimica dei composti aromatici:: benzene, strutture di Kekulè, aromaticità negli areni e nei composti eteroaromatici. Regola di Huckel. Nomenclatura e proprietà dei composti aromatici: alogenuri, acidi carbossilici, fenoli, ammine, composti aromatici policondensati. Reazione di sostituzione elettrofila aromatica (nitrazione, alogenazione, solfonazione, reazioni di Friedel-Crafts): meccanismo e dati cinetici. Orientamento nella reazione di sostituzione su anelli con un sostituente. Gruppi attivanti e disattivanti, orientamento nella sostituzione. Sostituzione su anelli con più di un sostituente. Fenoli ed aniline. Reazioni di sostituzione nucleofila aromatica: attivazione dell’anello, orientamento, meccanismo di reazione. Reazione di ossidazione di catene laterali di composti aromatici. Reazioni di riduzione di sistemi aromatici.

   

13.

Acidi carbossilici e loro derivati: Proprietà del gruppo carbossilico. Acidità. Nomenclatura e proprietà chimico-fisiche. Preparazioni degli acidi carbossilici. Trasformazione degli acidi carbossilici nei principali derivati: alogenuri, anidridi, ammidi e esteri. Reattività del gruppo carbossilico: addizione nucleofila-eliminazione al carbonio acilico. Preparazione dei cloruri acilici via cloruro di tionile. Preparazione delle anidridi. Preparazione degli esteri: il meccanismo della reazione di esterificazione di Fisher. Idrolisi dei derivati degli acidi. La reazione di decarbossilazione. I composti -dicarbonilici: la condensazione di Claisen, la sintesi acetoacetica e la sintesi malonica.

14.

Ammine: Struttura e loro diffusione in natura. Nomenclatura e proprietà chimico-fisiche Basicità. Preparazioni: reazione di ammoniaca e ammine con alogenuri alchilici; riduzione delle azidi, di immine e di nitrocomposti. Nitrosazione di ammine aromatiche. La reazione di Sandmeyer e sintesi di azocomposti.

15.

Composti eterociclici: Nomenclatura. Composti eterociclici aromatici. Reazioni degli eterocicli come acidi e basi. Reazioni di sostituzione elettrofila aromatica degli eterocicli pentaatomici e loro benzocondensati. Eterocicli azotati: pirrolo e piridina. Basicità di pirrolo e piridina. Reazioni di sostituzione aromatica sulla piridina.

16.

Carboidrati: struttura e distribuzione. Stereochimica degli zuccheri. Proiezione di Fisher. Determinazione della configurazione assoluta. La mutarotazione. Reazione di formazione di emiacetali: strutture cicliche dei monosaccaridi. Formule di Haworth. Effetto anomerico. Formazione dei glucosidi.  Reazioni di ossidazione dei monosaccaridi: ossidazione con periodato, reattivo di Benedict e di Tollens. Zuccheri riducenti. La reazione con fenilidrazina. Principali monosaccaridi: glucosio e fruttosio. Disaccaridi: lattosio, maltosio e saccarosio. Polisaccaridi: amido e cellulosa.

17.

Amminoacidi e peptidi: Struttura, proprietà e stereochimica. Classificazione degli amminoacidi presenti nelle proteine. Gli amminoacidi come acidi e basi. Determinazione della struttura dei peptidi: struttura primaria, secondaria, terziaria e quaternaria. Degradazione delle proteine in peptidi e amminoacidi: idrolisi acida, degradazione enzimatica. Sintesi di peptidi: attivazione del gruppo carbossilico e formazione del legame peptidico.

 

Testi di riferimento

T.W. Graham Solomons, C.B. Fryhle

“Chimica Organica” - Zanichelli - 3a Ed. Italiana sulla nona Ed. Americana, 2009. 

Testi consigliati

J. McMurry “Chimica Organica” Zanichelli.

Brown-Foote, "Chimica Organica" IV Edizione, 2009, Edises.

 

 

 

 

Programma () del corso di

Chimica Organica Avanzata

  1. Studio e descrizione dei principali meccanismi di reazione
  2. Aromaticitŕ
  3. Teoria delle reazioni concertate
  4. Reazioni pericicliche: cicloaddizioni, Reazioni elettrocicliche, Riarrangiamenti sigmatropici.
  5. Reazioni organiche catalizzate da metalli di transizione:  formazione di legami C_C tramite Suzuki coupling, reazione di Sonogashira e reazione di Stille .
  6. Formazione di doppi legami C=C  tramite reazione di metatesi, Peterson, Wittig and Wittig-Horner.
  7. Principali reazioni asimmetriche quali epossidazione, diidrossilazione e amminoidrossilazione.
  8. Esperienze di laboratorio sulle principali e piů moderne reazioni orgamiche.

  

Testi consigliati

  • Carey. R.J. Sundberg, “Advanced Organic Chemistry”- Part A, Plenum Press London.

  • F.A. Miller, P.H. Solomon., “Writing Reaction Mechanism in Organic Chemistry”, Academic Press, II ed.

  • I. Fleming, “Frontier Orbitals and Organic Chemical Reactions”, J. Wiley and Sons, 2005.

  • T. L. Gilchrist, R. C. Storr. “Organic Reactions and orbital symmetry”, Cambridge University Press.

  • E. N. Jacobsen, A. Pfaltz, H. Yamamoto, “Comprehensive Asymmetric Catalysis”, Vol II. Springer Editor.
     


 

 

Programma () del corso di

Chimica Organica dei Prodotti Bioattivi

 

Programma

In questo corso si vuole fornire agli studenti la conoscenza delle caratteristiche di un farmaco; la conoscenza dei rapporti struttura attività; principi di farmacocinetica e farmacodinamica; conoscenza dei criteri di scelta delle modifiche più opportune da fare per l’ottenimento di analoghi. Principi di sintesi asimmetrica per la sintesi di strutture farmacologicamente attive; conoscenza del percorso di approvazione di un farmaco e sua produzione. Si approfondirà la conoscenza dei composti inibitori di enzimi con particolare attenzione al virus dell’HIV e alla sintesi di nuovi composti antivirali.

 

Contenuti:

  1. Classificazione dei farmaci, disegno delle strutture, provenienza naturale, stabilità.

  2. Relazione struttura-attività, sintesi di analoghi, sviluppo e produzione

  3. Composti inibitori di enzimi

  4. Sintesi di strutture ad attività antivirale

  5. Principali metodi di sintesi asimmetrica per l’ottenimento di composti farmacologicamente attivi: diidrossilazione, amminoidrossilazione ed epossidazioni.

  6. Importanza degli anelli eterociclici nei composti farmacologicamente attivi.

 

 

Testi di riferimento

  1. Gareth Thomas, “Medicinal Chemistry, an introduction”, Wileey Interscience

  2. H.P. Rang, M.M. Dale, J. M. Ritter, P. K. Moore, “Farmacologia”, Casa Editrice Ambrosiana per l’edizione italiana.

  3. W. Cabri, R. Di Fabio, “From bench to market”, Oxford University Press

  4. E. N. Jacobsen, A. Pfaltz, H. Yamamoto, “Comprehensive Asymmetric Catalysis”, Vol II. Springer Editor

 

 

 

Orario Ricevimento Studenti:

(presto online)

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Date Appelli di Chimica Organica per Biotecnologie:

28 marzo 2011 ore 10.30
9 maggio 2011 ore 10.00
20 giugno 2011 ore 9.30
27 luglio 2011 ore 9.30
20 settembre 2011 ore 9.30
28 ottobre 2011
29 novembre 2011
16 gennaio 2012
13 febbraio 2012

 

 

 

 

 

Materiale didattico
Aromaticità
Aspetti generali sui meccanismi di reazioni organiche

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

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Webmaster: Giuseppe Pace